sudo apt-get install build-essential g77
sudo apt-get install refblas3 refblas3-dev
sudo apt-get install r-base-core r-base-dev r-bioc-repostools r-recommended

装完之后
sudo R
进入R命令行

source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()

默认将安装一下几个包

affy affydata affyPLM
annaffy annotate Biobase
Biostrings DynDoc gcrma
genefilter geneplotter hgu95av2
limma marray matchprobes
multtest ROC vsn
xtable affyQCReport

如果需要Bioconductor或CRAN上别的包的话，可以使用
biocLite(c("pkg1", "pkg2"))
来安装（pkg1和pkg2为需要安装的包）。